A série se passa em Terra II, um planeta distante da Terra. Trezentos anos antes do início da história, o navio colônia humana Mesopotâmia sofreu uma grande catástrofe, que matou quase todos a bordo. Seis homens fugiram usando um pod de emergência e conseguiram pousar na superfície do planeta. Sem meios para retornar ou contatar a Terra, eles decidiram colonizar o planeta usando clones de si mesmos, mas o equipamento não foi capaz de produzir clones do sexo feminino — o que resultou numa sociedade totalmente masculina que passou a usar marionetes robóticas para preencher o papel social das mulheres. Garotas Marionetes J (1996) é uma animação japonesa que constrói, a partir dessa premissa incomum de ficção científica, uma reflexão sobre gênero e identidade rara para o anime da época, num tom que hoje seria classificado como precursor de discussões que só ganhariam espaço décadas depois no gênero.